Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAPNS2Q96L46 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAPNS2Q96L46 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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