Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIC2Q96JB3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms