Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC97Q96F63 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms