Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.915e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 CMTR1-202ENST00000455891 1280 ntTSL 220.59■□□□□ 0.895e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.885e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.885e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.876e-11■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-210ENST00000562171 707 ntTSL 320.44■□□□□ 0.865e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 P4HB-204ENST00000466567 872 ntTSL 220.43■□□□□ 0.865e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.855e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 VARS-218ENST00000459667 793 ntTSL 320.35■□□□□ 0.855e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SYNE4-205ENST00000490730 1175 ntTSL 220.33■□□□□ 0.855e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-221ENST00000459656 1901 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.845e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.835e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 VARS-224ENST00000479051 612 ntTSL 320.23■□□□□ 0.835e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.814e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SEMA4C-202ENST00000442264 817 ntTSL 320.01■□□□□ 0.795e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 520■□□□□ 0.795e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 219.99■□□□□ 0.795e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.725e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 219.43■□□□□ 0.78e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.675e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-225ENST00000471533 329 ntTSL 319.05■□□□□ 0.645e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.638e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.625e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.625e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TUBG1-202ENST00000588056 574 ntTSL 218.92■□□□□ 0.625e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TUBG1-205ENST00000591509 847 ntTSL 318.92■□□□□ 0.625e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.625e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.585e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TJP2-205ENST00000423935 614 ntTSL 218.64■□□□□ 0.575e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ST6GALNAC4-202ENST00000361444 1013 ntTSL 518.57■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.555e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MTA1-208ENST00000438610 2144 ntTSL 1 (best)18.47■□□□□ 0.558e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.545e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.535e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.528e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SYNE4-204ENST00000465425 2339 ntTSL 218.23■□□□□ 0.515e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 AL136531.2-201ENST00000618770 1164 ntTSL 218.12■□□□□ 0.495e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.498e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.485e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SOAT2-202ENST00000542365 1797 ntTSL 217.99■□□□□ 0.475e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.458e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FAM193B-219ENST00000524677 1916 ntTSL 217.76■□□□□ 0.435e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LMBR1L-209ENST00000548983 522 ntTSL 417.74■□□□□ 0.435e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-212ENST00000428692 541 ntTSL 417.54■□□□□ 0.45e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LMBR1L-205ENST00000547670 1866 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.375e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 217.27■□□□□ 0.365e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DHRS12-208ENST00000490949 671 ntTSL 417.19■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LMBR1L-210ENST00000549296 560 ntTSL 517.13■□□□□ 0.335e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LMBR1L-203ENST00000457164 1081 ntTSL 217.05■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 23.5
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TBRG4Q969Z0 LMBR1L-217ENST00000551115 965 ntTSL 1 (best)17.05■□□□□ 0.325e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FAM193B-209ENST00000507212 717 ntTSL 217.01■□□□□ 0.315e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 AC104809.2-202ENST00000457369 800 ntTSL 316.91■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.285e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 216.78■□□□□ 0.285e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LPCAT1-204ENST00000507282 417 ntTSL 216.66■□□□□ 0.265e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ANP32A-208ENST00000495420 707 ntTSL 216.65■□□□□ 0.265e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FAM193B-204ENST00000505569 1870 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.255e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SYNE4-207ENST00000505054 713 ntTSL 316.56■□□□□ 0.245e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NBAS-202ENST00000417461 1330 ntTSL 216.51■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FBXL21-208ENST00000635168 2693 ntTSL 516.48■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.215e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 LMBR1L-225ENST00000552153 549 ntTSL 416.35■□□□□ 0.215e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.25e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.195e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.185e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ZNF251-202ENST00000524394 315 ntTSL 516.14■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ST6GALNAC4-205ENST00000479747 732 ntTSL 316.09■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-203ENST00000465058 534 ntTSL 416■□□□□ 0.155e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-211ENST00000479504 559 ntTSL 416■□□□□ 0.155e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 VARS-216ENST00000428445 863 ntTSL 515.93■□□□□ 0.145e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.135e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ATG4B-201ENST00000344376 1566 ntTSL 515.75■□□□□ 0.116e-11■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.115e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.18e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NBAS-209ENST00000485694 1798 ntTSL 215.69■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.15e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 FAM193B-212ENST00000510163 2237 ntTSL 1 (best)15.66■□□□□ 0.15e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SOAT2-203ENST00000551896 570 ntTSL 215.54■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.085e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 IGF2BP3-204ENST00000466809 588 ntTSL 515.53■□□□□ 0.085e-9■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 515.49■□□□□ 0.075e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SENP2-202ENST00000413407 2383 ntTSL 215.38■□□□□ 0.055e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.055e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ST6GALNAC4-203ENST00000467674 812 ntTSL 215.09■□□□□ 0.015e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.015e-6■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.028e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.025e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.035e-7■■■■□ 23.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 23.5
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