Protein–RNA interactions for Protein: Q969X5

ERGIC1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC1Q969X5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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ERGIC1Q969X5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ERGIC1Q969X5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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ERGIC1Q969X5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ERGIC1Q969X5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ERGIC1Q969X5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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ERGIC1Q969X5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ERGIC1Q969X5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERGIC1Q969X5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ERGIC1Q969X5 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERGIC1Q969X5 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ERGIC1Q969X5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERGIC1Q969X5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ERGIC1Q969X5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ERGIC1Q969X5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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