Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCAMP4Q969E2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms