Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BHMTQ93088 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms