Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113Q902F9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms