Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNIH3Q8TBE1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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