Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LTBP4Q8N2S1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LTBP4Q8N2S1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms