Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD163Q86VB7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms