Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRAPPC6BQ86SZ2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRAPPC6BQ86SZ2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC6BQ86SZ2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TRAPPC6BQ86SZ2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TRAPPC6BQ86SZ2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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