Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
USP31Q70CQ4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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