Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMARCD3Q6STE5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms