Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZBED9Q6R2W3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms