Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TUBA3EQ6PEY2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TUBA3EQ6PEY2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms