Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD54Q6NXT1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms