Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
WSCD1Q658N2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms