Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIF1Q5UIP0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms