Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
COL5A1-AS1Q5SY13 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
COL5A1-AS1Q5SY13 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms