Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ1

DEFB133, Beta-defensin 133, humanhuman

Predictions only

Length 61 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB133Q30KQ1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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DEFB133Q30KQ1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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DEFB133Q30KQ1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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DEFB133Q30KQ1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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DEFB133Q30KQ1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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DEFB133Q30KQ1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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DEFB133Q30KQ1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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DEFB133Q30KQ1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFB133Q30KQ1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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