Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CA9Q16790 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CA9Q16790 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CA9Q16790 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CA9Q16790 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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