Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCBQ16585 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCBQ16585 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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