Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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EXT1Q16394 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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EXT1Q16394 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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EXT1Q16394 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EXT1Q16394 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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