Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZIC1Q15915 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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