Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
ZFHX3Q15911 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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ZFHX3Q15911 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
ZFHX3Q15911 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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