Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP6AP1Q15904 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP6AP1Q15904 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms