Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NEDD8Q15843 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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