Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA2Q15822 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHRNA2Q15822 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
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