Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIP4Q15650 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms