Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RABEP1Q15276 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms