Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCOLCEQ15113 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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