Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GAPVD1Q14C86 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GAPVD1Q14C86 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GAPVD1Q14C86 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GAPVD1Q14C86 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GAPVD1Q14C86 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GAPVD1Q14C86 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GAPVD1Q14C86 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GAPVD1Q14C86 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GAPVD1Q14C86 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GAPVD1Q14C86 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
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