Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
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