Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSPNQ14714 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSPNQ14714 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms