Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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COL4A6Q14031 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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