Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CBFBQ13951 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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