Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2BQ13554 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms