Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PMS2P3Q13401 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms