Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN3Q13286 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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