Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NME3Q13232 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NME3Q13232 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NME3Q13232 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NME3Q13232 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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NME3Q13232 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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NME3Q13232 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NME3Q13232 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NME3Q13232 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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