Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DUSP4Q13115 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DUSP4Q13115 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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