Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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