Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTP4A2Q12974 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
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