Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXF2Q12947 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXF2Q12947 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms