Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAF2Q12933 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TRAF2Q12933 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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