Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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