Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFRD2Q12894 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms