Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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RASGEF1BQ0VAM2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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