Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM27E3Q08E93 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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